É muito variável. A taxa de sobrevivência em 10 anos é de 65%, mas muitos casos sofrem remissão espontânea após anos de tratamento. Tanto a morte como as limitações físicas são mais freqüentes no início da doença do tipo difuso quando são atingidos pulmões, coração e rins. Na esclerodermia limitada a mortalidade deve-se à hipertensão de artéria pulmonar ou à má absorção intestinal.